DGKA-nın beynəlxalq akademik əməkdaşlığının başlıca məqsədi qarşılıqlı faydalı tərəfdaşlıqların və əlaqələrin yaradılması və genişləndirilməsidir. Xarici əlaqələrin əsas fəaliyyət istiqamətləri aşağıdakılardır:

• Xarici ali təhsil müəssisələri ilə ikitərəfli əməkdaşlıqlar
• Beynəlxalq və Avropa İttifaqı akademik mübadilə proqramları
• Digər beynəlxalq strukturlarla (təşkilatlar, şəbəkələr, birliklər və s.) akademik əməkdaşlıq

Akademiya aşağıdakı beynəlxalq akademik strukturlarla müxtəlif formalarda tərəfdaşlıq edir:

• Ümumdünya Gömrük Təşkilatı (ÜGT), Gömrükdə Akademik Tədqiqatlar və İnkişaf üçün Tərəfdaşlıq (PICARD) proqramı
• Gömrük Universitetlərinin Beynəlxalq Şəbəkəsi (INCU)
• Gömrük və əlaqədar sahələrdə xarici elmi tədqiqat jurnalları (yeni prioritet sahədir), xüsusilə, ÜGT Jurnalı